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Bienvenue sur la collection MicroScope, vous y trouverez les publications scientifiques qui ont utilisé la plate-forme MicroScope

MicroScope membre des infrastructures IFB et France Génomique est la plate-forme d'annotation et d'analyse du génome microbien du LABGeM - CEA/Genoscope sous la tutelle CEA, CNRS et Université Evry Val de Seine

Les différentes activités de la plate-forme MicroScope sont : L'innovation de génomes microbiens (génomes et métagénomes assemblés) et développement d'outils destinés à l'annotation, à la génomique et au métabolisme comparatifs de génomes bactériens; la génomique comparative et pangénomique; la prédiction de fonction et de processus biologiques; la reconstruction de réseaux métaboliques; l'analyse de données de transcriptonique; l'assistance techniques; la formation à l'annotation de génomes procaryotes et à la curation de réseaux métaboliques.

COLLABORATION INTERNATIONALE

 

 Pour toute question : hal@cea.fr

 

NOMBRE DE TEXTES INTEGRAUX

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NOMBRE DE NOTICES

86

INDICATEUR D'OPEN ACCESS

88 %

MOTS CLES

Phylogeny Functional annotation Comparative genomics Pangenome ACL Metabolomics Bacterial genetics Entomopathogenic bacteria Acyl homoserine lactone CTX-M-15 Nitrogen fixation Virulence Genome Rhizobium FAMILY Proteomics Genome evolution Transcriptome ESBL Fish pathogens Mineral weathering Directed evolution Gut microbiota Acinetobacter baumannii Formate assimilation Alkaline thermal spring Food Metagenomics Adaptation Bacteriophage Cyanobacteria Activated sludge Microbiology Pathogenicity Magnetotactic bacteria Betaproteobacteria Symbiosis Bacteria Secondary metabolites Mobile genetic elements Rhizobia Horizontal gene transfer Metabolism Complete genome HGT Bactérie entomopathogène Coevolution Dehalogenation Flavobacteriaceae Genome sequence Aquaculture Plasmid Biofilm Evolution DNA Clostridioides difficile Genomes Heavy metal resistance Archaea Continuous culture Comparative genomic analysis Bacteroidetes Bacterium Gene regulation Biodiversity Oxidative stress Bioremediation Brochothrix thermosphacta Virulence factors Galactose Bacteriocin Bacterial Polyphasic taxonomy Escherichia coli Thermophile Average nucleotide identity Genomics Antibiotic resistance Functional genomics Transcriptomics Flavobacterium psychrophilum Acid mine drainage AMD Dichloromethane Anaerobic Genome-scale metabolic networks DDDH Bactérie Lactic acid bacteria Actinorhizal symbiosis Acidithiobacillus ferrooxidans Bioassays Experimental evolution Thermococcus Genome mining Arsenic Digital DNA-DNA hybridization Fish-pathogenic bacteria Agrobacterium tumefaciens Fitness cost Fish pathogen